قدم المؤلف لكتابه ببيان أهمية دراسة موضوع مشكل القرآن، والدراسات السابقة التي تعرضت لهذا الموضوع، تلاها بالتمهيد، وأربعة فصول وخاتمة، في الفصل الأول: مشكل القرآن الكريم، الثاني: أسباب وقوع الإشكال في القرآن الكريم، الثالث: أنواع مشكل القرآن الكريم، وفي الرابع: طرق دفع الإشكال عن آيات القرآن الكريم.
